Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms