Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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TAF11Q15544 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF11Q15544 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF11Q15544 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF11Q15544 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF11Q15544 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF11Q15544 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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TAF11Q15544 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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TAF11Q15544 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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TAF11Q15544 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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TAF11Q15544 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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TAF11Q15544 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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TAF11Q15544 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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TAF11Q15544 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms