Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNB1Q14721 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms