Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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