Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms