Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM29Q14134 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM29Q14134 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms