Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms