Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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