Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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