Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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AP3B2Q13367 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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AP3B2Q13367 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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AP3B2Q13367 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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AP3B2Q13367 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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