Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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