Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CBX3Q13185 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CBX3Q13185 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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