Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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