Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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