Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACACAQ13085 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms