Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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