Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms