Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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