Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TROQ12816 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TROQ12816 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TROQ12816 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TROQ12816 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms