Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms