Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms