Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms