Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms