Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms