Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB4BP68371 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms