Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms