Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms