Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLCSP50747 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLCSP50747 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLCSP50747 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLCSP50747 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLCSP50747 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLCSP50747 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLCSP50747 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLCSP50747 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms