Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL1P50553 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL1P50553 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms