Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP153P49790 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms