Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1EP49674 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms