Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNTBP49356 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNTBP49356 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FNTBP49356 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FNTBP49356 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FNTBP49356 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FNTBP49356 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FNTBP49356 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FNTBP49356 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FNTBP49356 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FNTBP49356 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FNTBP49356 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms