Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms