Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARGP37231 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARGP37231 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARGP37231 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARGP37231 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPARGP37231 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARGP37231 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms