Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms