Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms