Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRGP23470 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRGP23470 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRGP23470 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRGP23470 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRGP23470 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRGP23470 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRGP23470 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRGP23470 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRGP23470 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRGP23470 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms