Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms