Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms