Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms