Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DPA1P20036 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DPA1P20036 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms