Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms