Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFTRP13569 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFTRP13569 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CFTRP13569 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFTRP13569 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFTRP13569 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFTRP13569 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFTRP13569 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFTRP13569 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFTRP13569 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFTRP13569 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFTRP13569 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms