Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms