Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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