Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms