Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRPRAP08240 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms