Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms