Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms