Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNSO60931 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNSO60931 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNSO60931 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNSO60931 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNSO60931 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNSO60931 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNSO60931 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms